En regnskapsbok for Helgøy kirke 1716-1885 (nr. 44) ble levert til Statsarkivet i Tromsø i 1987, etter å ha blitt funnet i Brønnøysund. Resten av arkivet ble avlevert i 1989. En del av det ble hentet ved inspeksjon hos soknepresten i Karlsøy. Det øvrige, dvs. den eldste delen av arkivet, ble innlevert til Statsarkivet i Tromsø av Håvard Dahl Bratrein ved Tromsø Museum, som hadde fått låne dette materialet i 1977 i forbindelse med utarbeidelse av bygdeboka. En skoleprotokoll for Helgøy skolekommune (nr. 62) er også kommet fra Tromsø Museum. Den ble overført til statsarkivet i 1993.