Serien er ordnet etter vassdrag, sak og mappe. Arkivprotokoller fins. Materiale er overført til andre serier. Les mer nedenfor. Vassdragsarkivet er en serie som innholder saker om f.eks: dampskipsfart, elvebrudd, kraftledinger, forbygninger, kanaler, vassdragskonsesjoner, fløtning, nivellement, vassdragsregulering, hydrologiske målinger, vannstandsmålinger, elektrisitetsforsyning, kraftanlegg for jernbaneanlegg, m.v. Til serien hører arkivprotokoller. De har viktige opplysninger om ordningen av arkivet samt hva som er blitt tatt ut fra serien (se nedenfor). Protokollene må brukes for detaljert informasjon om saker. Serien ble påbegynt under 1800-tallet på kanalvesenets tid og har løpt gjennom mange organisatoriske endringer til det ble satt bort på 1960-tallet. Man har dog tilført noen dokumenter etter den tid og det er derfor serien tilsynelatende strekker seg helt opp til 1995. Det er plukket ut materiale fra arkivet ved forskjellige tilfeller: Planmapper/anleggsmapper: I 1924 plukket Kanalavdelingen ut det materiale vedr. forbygnings- og anleggsvirksomhet. Materialet ble grunnlaget for en serie med planmapper/anleggsmapper. I arkivprotokollen til serien angis de utplukkede sakene med et rødt kryss. I 1985 avleverte Forbygningsavdelingen (etterfølgeren til Kanalavdelingen) eldre forbygningssaker til Riksarkivet. Sakene ble plukket ut av "Vassdragsarkivet" i 1924. I 2002 besluttet Riksarkivet at disse sakene skulle tilbakeføres til NVE og ordnes og integreres med arkivdelene som var i NVE. (NVE ref 200104455-3, RA ref 02/1999). De inngår i dag i "Vassdragsarkivet". Konsesjoner: Noen konsesjonsdokumenter er tatt ut og dannet en egen serie. Vannverker- og kloakkanlegg: For hvert fylke er det registrert saker om vann- og kloakk. Disse sakene ble plukket ut og overført til fylkesmannen. Sannsynligvis under 1970-tallet. Saksarkiv etter arkivnøkkel: I 1969 startet NVE å tillempe Felles arkivnøkkel for statsforvaltningen. Etter hvert overførte man mapper fra "Vassdragsarkivet" til Vassdragsdirektoratets "nye" saksarkiv. I arkivprotokollen fin henvisninger til arkivkoden saken nå ligger. I hovedsak er det følgende arkivkoder: 561 – Vassdragskonsesjoner og tillatelser, 562 – Konsesjonsavgifter, 563 – Vassdragstilsyn, 566 – Oppgaver til Riksskattestyret og 568 – Landskapspleie/naturvern ifm kraftutbygging. Henvisningen angir oftest arkivkode, men det kan også stå "gul mappe".Tidligere ordning: Ordningen av serien har variert over tid. Før sluttordningen av arkivet i 2003 var serien delt i seks forskjellige underserier: i nummerrekkefølge, alfabetisk etter vassdrag, ordnet etter fylke, fløtningssaker, grensevassdrag og de eldre arkivsakene fra Riksarkivet. De er nå samsortert i en serie og ordnet etter hvordan serien er registrert i arkivprotokollen. Fotografier: Serien innholder fotografier og disse er i all hovedsak registrert. Materialet oppbevares i syrefritt fotobevaringsmateriale. Løse fotografier er flyttet over i syrefrie konvolutter. Dersom foto er limt eller stiftet på ark er det plassert beskyttende japanpapir mellom arkene. Et utvalg av fotografiene er skannet. Filene oppbevares hos NVE.