Kåfjord hørte med til Lyngen prestegjeld. Kgl.res. 21.6.1929 delte Lyngen hovedsokn i tre sokn: Kåfjord, Storfjord og Lyngen. Ved kgl.res. 2.6.1978 ble Kåfjord sokn utskilt fra Lyngen som eget prestegjeld.