Tranøy prestegjeld var inntil 1759 et residerende kapellani under Ibestad (Astafjord) prestegjeld. Ved kallsbrev av 5.1.1759 ble det fastsatt at Tranøy, med Dyrøy kapell, skulle være et selvstendig prestegjeld. Ny kirke ble bygget i Dyrøy i 1777 (flyttet fra Havn til Holm). Kgl.res. 24.2.1824 ga beboerne i Reisa (Sørreisa) tillatelse til for egen regning å bygge seg kirke. Kirken ble vigslet 20.10.1844. Ved kgl.res. 24.2.1933 ble det besluttet å flytte dette kirkehuset fra Tømmervik til Nordstraum. Kirken brant ned 4.11.1987. Reisa nevnes som annekssokn fra 1844. Ved kgl.res. 6.11.1969 ble Sørreisa og Dyrøy sokn utskilt fra Tranøy som eget soknekall og fikk navnet Sørreisa prestegjeld. Delingen av prestegjeldet ble iverksatt fra 1.1.1970. Kgl.res. 27.1.1896 ga tillatelse til å bygge et kapell på Stonglandseidet. Kapelldistriktet ble sokn ved kgl.res. 11.7.1913. 1.1.1964 ble Bjarkøy kommunes område på Senja og øya Lemmingvær overført til Tranøy kommune (kgl.res. 11. januar og 6. juni 1963). I samsvar med denne endringen i kommuneinndelingen ble også den kirkelige inndelingen revidert slik at de nevnte områdene ble overført fra Bjarkøy sokn og prestegjeld til Stonglandet sokn i Tranøy prestegjeld. 1.1.1994 ble Tranøy og Stonglandet sokn slått sammen til ett sokn, Tranøy.