Skien distriktsfengsel ble opprettet etter kgl.res. 10.10.1864. Byfogden i Skien ble bestyrer av distriktsfengselet i Skien samt alle tinglagsarrestene i landdistriktet. Overtilsynet lå under Bratsberg amt. De øvrige kjøpstedene og ladestedene i Bratsberg amt dannet i perioden 1864 - 1866 hver for seg egne distriktsfengsler som bare omfattet vedkommende by. Ved res. 24.11.1874 ble politimesteren i Skien utnevnt til bestyrer. I henhold til lov om fengselsvesenet av 12.12.1903 (i verksatt i 1904) ble administrasjonen overført til Staten, og navnet ble forandret til Skien kretsfengsel. I 1970 ble fengslet underlagt Søndre fengselsdistrikt. Direktøren for Sem kretsfengsel ble bestyrer av distriktet, og fra 1975 ble bestyrelsen lagt til direktøren for Berg kretsfengsel i Tønsberg. Det gamle fengselet ble nedlagt i 1985. og nybygg på Rødmyr tatt i bruk i 1993. Fra 2000 lå fengselet under Kriminalomsorgen Region Sør, med egen direktør for regionen. Navnet ble samtidig omgjort til Skien fengsel.